Церковь Рождества Пресвятой Богородицы в селе Подчерково строилась на средства московских купцов, уроженцев села Подчерково — Ф. Т. Маталасова и С. И. Марина, в период с 1851 по 1863 год и была освящена в 1864 году. Здание храма представляло собой кирпичную церковь в русском стиле, увенчанную декоративным пятиглавием, с двухъярусной колокольней.
В 1878 году здание церкви частично было реконструировано по проекту Льва Львова: на храме поставлены малые главы, а на колокольне выстроен дополнительный ярус. В 1891 году в храме был освящён придел Сергия Радонежского, в 1895 году — Фeoдора Стратилата.
Здание кирпичное, на белокаменном цоколе с белокаменными деталями. Притвор, соединивший храм с колокольней относится к концу XIX века. Трехъярусная столпообразная колокольня завершена выразительной кровлей сложного силуэта в стиле барокко.
В советское время здание церкви долгое время было закрыто. После многих лет нахождения в заброшенном состоянии, храм был передан прихожанам и открыт в 1998 году. Сразу началось его восстановление. В настоящее время храм отремонтирован, построена ограда.
29 сентября 2013 г. на приходе Богородицерождественского храма с. Подчёрково Дмитровского благочиния состоялось освящение колоколов.
Комплект из семи колоколов общим весом 350 кг был приобретён на средства прихожан.
В 2024 году храм отмечает 160-летие со дня освящения.